وحددت الجامعة رسوم الدراسة في كلية طب الأسنان 20 مليون جنيه للسودانيين و10 آلاف دولار للطلاب الأجانب.

بينما بلغت رسوم كلية الصيدلية 15 مليون جنيه للسودانيين مقابل 6 آلاف دولار للأجانب،.

فيما حددت  رسوم علوم المختبرات الطبية بواقع 6250 مليون جنيه للسودانيين و2500 جنيه للأجانب، وكلية عليوم التمريض 10 ملايين للسودانيين مقابل 4 آلاف دولار للأجانب.

وفرضت رسوم كلية الصحة العامة وصحة البيئة بمبلغ 5 ملايين جنيه للسودانيين و2 ألف دولار للأجانب.